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杨庆勇

姓名

杨庆勇

性别

职称

教授

学位

博士

电话

027-87280877

邮箱

yqy@mail.hzau.edu.cn

政治面貌

中共党员

工作单位

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研究方向

生物信息学;基因组学;系统遗传学

教育经历

2007.9 - 2012.6,威斯尼斯人娱乐官方网址,作物生物技术,博士。

2003.9 - 2007.6,威斯尼斯人娱乐官方网址,生物技术(双学位),学士。

2003.9 - 2007.6,威斯尼斯人娱乐官方网址,农村区域发展,学士。

主要职历

2021.11 - 至今,威斯尼斯人娱乐官方网址,威斯尼斯人官方娱乐网站,教授,硕士生/博士生导师

2016.12 – 2021.11,威斯尼斯人娱乐官方网址,威斯尼斯人官方娱乐网站,副教授,硕士生/博士生导师

  (2018.02~2018.08期间,新加坡国立大学计算机学院访问学者)

  (2020.01~,新疆农垦科学院挂职,省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室副主任,生物信息团队负责人)

2015.03 - 2016.12,威斯尼斯人娱乐官方网址,威斯尼斯人官方娱乐网站,副教授,硕士生导师

2012.07 - 2015.03,威斯尼斯人娱乐官方网址,生命科学技术学院,博士后

科研成果



主持或参加科研项目及人才计划项目情况


(1)   国家重点研发计划(农业生物重要性状形成与环境适应性基础研究),经济作物重要性状平行驯化与改良演化规律,2021YFF10001002021/12-2026/11188万元(个人可支配),主持子任务。

(2)  国家重点研发计划(政府间国际科技创新合作重点专项),利用基因组学途径提高油菜含油量的合作研究,2017YFE01048002018/01-2020/12100万元(个人可支配),主持子课题。

(3)  国家重点基础研究发展计划(973计划),2015CB250100,油菜高产油量形成的分子生物学机制--高含油量油菜种胚油脂优势积累的代谢特点和分子基础(子课题4),2015/01-2019/12208万元(个人可支配),主持子任务。

(4)  国家自然科学基金面上项目,32070559,油菜含油量主效位点BnPMT6的生物学功能与作用机理研究,2021/01-2024/12,直接经费58万元,主持

(5)  国家自然科学基金青年科学基金项目,31301005,基于SNP芯片和重测序技术鉴定油菜中新的高油酸位点及其候选基因2014/01-2016/1225万元,主持

(6)  中国博士后科学基金会特别资助项目,2014T70710,结合连锁和关联分析解析油菜高酸性状的遗传基础,2014/06-2015/0615万元,主持。

(7)  中国博士后科学基金会面上项目,2013M542033,基于SNP芯片和重测序技术鉴定油菜中新的高油酸位点,2013/09-2014/095万元,主持。



代表性论文(*通讯作者,#并列第一作者)


(1) Yang Zhiquan#; Liang Congyuan#; Wei Lulu#; Wang Shengbo; Yin Feifan; Liu Dongxu; Guo Liang; Zhou Yongming

Yang Qingyong*. BnVIR: bridging the genotype-phenotype gap to accelerate mining of candidate variations for traits in Brassica napus. Molecular Plant, 2022, https://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674205222000508.通讯作者;12020 IF=13.164 5-year IF = 16.357

(2) Song Jiaming#; Guan Zhilin#; Hu Jianlin#; Guo Chaocheng; Yang Zhiquan; WangShuo; Liu Dongxu; Wang Bo; Lu Shaoping;  Zhou Run; Xie Wenzhao; Cheng Yuanfang; Zhang Yuting; Liu Kede*; Yang Qingyong*; Chen Lingling*; Guo Liang*. Eight high quality genomes reveal pan-genome architecture and ecotype differentiation of Brassica napus. Nature Plants, 2020, 6(1): 34~45.共同通讯作者; 1区,2020 IF=15.7935-year IF= 17.349ESI高被引

(3) Wang Maojun#; Wang Pengcheng; Lin Min*; Ye Zhengxiu; Li Guoliang; Tu Lili; Shen Chao; Li Jianying; Yang Qingyong*; Zhang Xianlong*. Evolutionary dynamics of 3D genome architecture following polyploidization in cotton. Nature Plants, 2018, 4(2): 90~97.共同通讯作者; 1区,2020 IF=15.7935-year IF= 17.349ESI高被引

(4) Hu Yue#; Xiong Jie#; Shalby Nesma; Zhuo Chenjian; Jia Yupeng; Yang Qingyong*; Tu Jinxing*. Comparison of dynamic 3D chromatin architecture uncovers heterosis for leaf size in Brassica napus, Journal of Advanced Research. 2022,https://doi.or.org/10.1016/j.jare.2022.01.001共同通讯作者; 1区,2020 IF=10.48

(5) He Yizhou#; Yang Zhiquan#; Tang Minqiang; Yang Qingyong *; Zhang Yuanyuan*; Liu Shengyi. Enhancing canola breeding by editing a glucosinolate transporter gene lacking natural variation. Plant physiology, 2022, kiac021.共同通讯作者; 1区,2020 IF=8.34

(6) Tang Shan; Liu DongXu; Lu Shaoping; Yu Liangqian; Li Yuqing; Lin Shengli; Li Long; Du Zhuolin; Liu Xiao; Xiao Li; Ma Wei; Yang Qingyong*; Guo Liang*. Development and screening of EMS mutants with altered seed oil content or fatty acid composition in Brassica napus. Plant J. 2020, 104(5):1410~1422.共同通讯作者; 1区,2020 IF = 6.417 5-year IF = 7.627

(7) Song Jiaming#; Liu Dongxu #; Xie Wenzhao; Yang Zhiquan; Guo Liang; Liu kede ; Yang Qingyong*; Chen Ling-Ling*. BnPIR: Brassica napus Pan-genome Information Resource for 1,689 accessions. Plant Biotechnol J. 2021, 19: 412~414.共同通讯作者; 1区,2020 IF=9.8035-year IF = 9.555

(8) Liu Dongxu #; Yu Liangqian #; Wei Lulu #; Yu Pugang; Wang Jing; Hu Zhao; Zhang Yuting; Zhang Shuntai; Yang Zhiquan; Chen Guanqun; Yao Xuan; Yang Yanjun; Zhou Yongming; Wang Xuemin;  Lu Shaoping*; Dai Cheng*; Yang Qingyong* ; GuoLiang*.  BnTIR:an online transcriptome platform for exploring RNA-seq libraries for oil crop Brassica napus. Plant Biotechnol J. 2021, 19: 1895–1897.共同通讯作者; 1区,2020 IF=9.803 5-year IF = 9.555

(9) Gao Yingjie#; Yang Zhiquan#; Yang Wenqian#; Yang Yanbo; Gong Jing*; Yang Qingyong*;  Niu Xiaohui*. Plant-ImputeDB: an integrated multiple plant reference panel database for genotype imputation. Nucleic Acids Res. 2021a, 49: D1480~D1488.共同通讯作者; 1区,2020 IF=16.9715-year IF = 15.542

(10) Liu Dongxu#; Rajaby Ramesh#; Wei Lulu; Zhang Lei; Yang Zhiquan;  Yang Qingyong*, Sung WingKin*. Calling large indels  in 1047 Arabidopsis with IndelEnsembler. Nucleic Acids Res. 2021b, 49: 10879–10894.共同通讯作者;1区, 2020 IF=16.9715-year IF = 15.542

(11) Tao Jingfen#; Zhou Jinzhi; Xie Ting; Wang Xiaotao; Yang Qingyong*; Zhang Hongyu. Influence of chromatin 3D organization on structural variations of the Arabidopsis thaliana  genome. Molecular Plant, 2017, 10(2): 340~344.通讯作者; 1区,2020 IF=13.1645-yearIF = 16.357

(12) Xie Ting#; Yang Qingyong#; Wang Xiaotao; McLysaght Aoife*; Zhang Hongyu*. Spatial colocalization of human ohnolog pairs acts to maintain dosage balance. Molecular Biology and Evolution. 2016, 33(9): 2368~2375.并列第一作者;12020 IF=16.245-year IF = 18.670

(13) Xie Ting#; Zheng Juefei#; Liu Sheng; Peng Cheng; Zhou Yongming; Yang Qingyong*; Zhang Hongyu. De novo plant genome assembly based on chromatin interactions: A case study of Arabidopsis thaliana. Molecular Plant. 2015, 8(3): 489~492.通讯作者;12020 IF=13.1645-year IF = 16.357




发明专利授权情况


(1)  张红雨,杨庆勇,全源,罗志辉,朱丽达,多靶标药物和/或药物组合的筛选方法,中国, CN201510288863.8,授权时间:2017-09-15(已转化

(2)  周永明;刘晟;范楚川;杨庆勇;一种与甘蓝型油菜含油量QTL紧密连锁的分子标记,中国,CN201610013828,威斯尼斯人娱乐官方网址,授权时间:2018-04-18

(3)  张红雨; 全源; 王晖; 朱丽达; 许璇; 杨庆勇; 黄清,一种基于热扩散网络的药物发现方法及其应用,中国,CN201710917312.2,威斯尼斯人娱乐官方网址,授权时间:2019-09-06

(4)  张红雨,朱丽达,罗志辉,全源,朱强,杨庆勇,一种基于机器学习的药物活性预测方法,中国, CN201610067573.5,授权时间:2017-04-12(已转化


学术兼职


(1)  担任国家自然科学基金通讯评审专家国家重点研发计划会议评审专家等学术兼职。
(2)  担任SCI杂志《Frontiers in Plant Science》Associate Editor,以及《Plant Biotechnology Journal》、《BMC Biology》、《GCB Bioenergy》、《Scientific Reports》、《Heredity》、《BMC Genomics》、《Crop Science》、《Plant Physiology and Biochemistry》等多个SCI杂志和《作物学报》、《计算机学报》、《生物信息学》和《中国油料作物学报》等多个中文核心期刊的审稿人。


备注